本館南部分館暨國家聯合典藏中心新建工程，於109年1月15日獲內政部核發「候選綠建築證書(鑽石級)」及「候選智慧建築證書(黃金級)」兩項殊榮，為國家打造世界級文化地標更邁向新的旅程。

本新建工程建設計畫案於民國106年12月28日由行政院核定，為一座地下1層地上5層之建築物，總樓板面積約為5萬1千平方公尺。在設計暨監造單位—九典聯合建築師事務所和本館工作團隊合作努力下，依照基地條件及特性於室內外採用多元的生態、節能、減廢、健康手法；同時，透過通路控制、社區網絡、安全防災、節能管理等系統資訊整合機制，終獲內政部認可核發候選綠建築「鑽石級」及候選智慧建築「黃金級」證書，有效期限至114年1月14日止。